إسهاما من جامعة مصراتة في خلق روح البحث العلمي لدى طلابها ورغبة منها في إعداد المختصين في مختلف التخصصات العلمية فقد أولت برنامج الدراسات العليا® اهتماما خاصا وشجعت على المضي فيه. ولم تكن الدراسات العليا في هذه الجامعة حديثة العهد وإنما بدأت في بعض كلياتها قبل تأسيس الجامعة بهيكلتها الحالية وذلك عام 1987 م. ومن ذلك التاريخ أصبح عدد رسائل الماجستير التي تمنحها الجامعة يزداد حتى وصل إلى (580) رسالة مع نهاية العام 2018م. في شتى التخصصات العلمية. أما عدد الطلبة المنخرطين في برنامج الدراسات العليا فقد بلغ عددهم حتى هذا التاريخ (1028) طالبا وطالبة.
